On ignore les conditions de l’adhésion de Barthélemy Prieur au protestantisme. Est-il né dans un milieu protestant ? S’est-il lui-même converti ? En 1575, il quitta Paris et se réfugia une première fois à Sedan où il s’enfuit de nouveau en 1585 et où il séjourna sans doute jusqu’en 1591, date où Henri IV le nomma sculpteur du Roi. A ce titre, la surintendance des bâtiments du roi lui passa commande d'éléments décoratifs pour les façades du Louvre et autres bâtiments royaux.