Pas si simple de s’y retrouver. Selon des témoignages de 1792, 1818 et 1889 le cercueil contenait un crâne scié en deux parties à cause de l’embaumement.
Or, en 1896, on trouva cinq crânes dans le caveau et trois dans le même cercueil royal…On savait Louis XI très intelligent mais de là à posséder trois ou cinq têtes…Quant au crâne scié en deux, il serait constitué des fragments appartenant à deux individus différents. A force de découvertes et de manipulations, un joyeux mélange de restes retrouvés s’est obligatoirement opéré.
Quoiqu’il en soit, les crânes supposés de Louis XI et de Charlotte de Savoie sont dans la crypte protégés par une vitrine.
Quant aux ossements, selon les sources ils disparurent à la Révolution ou bien un certain nombre fut sauvé par des chanoines…Dans ce cas où sont-ils ? Dans le sarcophage ?
Commynes disait à propos de Louis XI : "Un roi dont l'esprit travaillait nuit et jour à tracer les routes de l'avenir." Pouvait-on lui dédier plus belle épitaphe ?